ORIGINI
Nel 1903 nella città ci fu un primo tentativo andato a vuoto di fondare una squadra di calcio. Due anni dopo, però, l'obbiettivo fu raggiunto con la fondazione dell'1. Mainzer Fussballclub Hassia 1905.
Dopo alcuni anni di militanza nella Süddeutschen Fußballverband (Campionato di calcio della Germania meridionale), il club si fuse con il FC Hermannia 07 – l'ex squadra di calcio del Mainzer TV 1817 – a formare il 1. Mainzer Fussballverein Hassia 05, che eliminò "Hassia" dal suo nome nell'agosto 1912. Un'altra fusione dopo la Prima guerra mondiale, nel 1919, questa volta con lo Sportverein 1908 Mainz, portò alla nascita dell'1. Mainzer Fußball- und Sportverein 05.
Die Nullfünfer formavano una squadra solida, che conquistò vari campionati nel periodo tra le due guerre e si qualificò per la prima fase del campionato nazionale nel 1921. Con la riorganizzazione del calcio tedesco ad opera del Terzo Reich nel 1933, il club si trovò a giocare in una delle sedici nuove seconde divisioni, quella Gauligen. La squadra, tuttavia, resistette solo un anno su quel livello prima di retrocedere. Nel 1938 fu costretta ad una fusione con il Reichsbahn SV Mainz e giocò con il nome di Reichsbahn SV Mainz 05 fino alla fine della Seconda guerra mondiale.
DOPOGUERRA
Dopo la guerra la squadra ritornò tra le compagini di vertice della Oberliga Südwest, dove rimase fino alla fondazione di una nuova lega professionistica, la Bundesliga, nel 1963. Per la maggior parte dei quattro decenni successivi il Mainz avrebbe giocato in terza divisione. Dagli ultimi anni settanta agli ultimi ottanta fu relegata nella Oberliga Sud-ovest Dilettanti, a causa di una serie di problemi finanziari. Il Mainz conquistò il Campionato tedesco dilettanti nel 1982. Il club tornò tra i professionisti nel 1990, con la promozione in Zweite Bundesliga (seconda serie tedesca). In tre circostanze, (1997, 2002 e 2003) la squdra fallì la promozione per un soffio, ma la tenacia pagò e, nel 2004, la squadra conquistò l'accesso in Bundesliga. Adesso, fuori dall'ombra dei vicini rivali di lunga data del Kaiserslautern (retrocessi nel 2006), la squadra sta disputando la sua terza stagione nella massima serie.
Nella sua stagione di esordio in Bundesliga il Mainz si è classificata all'11º posto. Ha ottenuto anche un posto in Coppa UEFA in qualità di squadra tedesca vincitrice del Premio Fair Play, assegnato dalla UEFA. I parametri esaminati per assegnare il premio sono: gioco corretto, rispetto dell'avversario, rispetto dell'arbitro, comportamento del pubblico e degli ufficiali di squadra, numero di ammonizioni e di espulsioni. Le sei vincitrici del Premio Fair Play sono qualificate di diritto al primo turno della Coppa UEFA. A causa della limitata capacità dello Stadio Bruchweg le partite casalinghe del Magonza in Coppa UEFA si sono giocate nella Commerzbank-Arena di Francoforte.
Die Nullfünfer giocano nello Stadio Bruchweg, costruito nel 1928 e modificato varie volte nel corso degli anni per contenere 20.300 spettatori. Il Mainz, che in Zweite Bundesliga poteva conta in media sul supporto di 15.000 tifosi, negli ultimi due anni disputati in massima divisione ha visto aumentare notevolmente il numero di sostenitori che assiepano il suo stadio.
Nella stagione 2005-2006 il Mainz si è classificato undicesimo. L'annata è ricordata anche per il prestigioso pareggio casalingo (2-2) contro il Bayern Monaco, futuro campione della Bundesliga. Autore di un gol memorabile è stato l'egiziano Mohamed Zidan, stella della squadra in prestito dal Werder Brema. L'anno seguente la squadra di Jürgen Klopp, malgrado un'esaltante rimonta che le ha permesso di uscire dalla zona retrocessione, non è riuscita a salvarsi a causa di un calo di condizione nelle ultime giornate, retrocedendo così in Zweite Bundesliga. Dopo due stagioni in seconda divisione, nel 2009 è risalita in Bundesliga grazie al secondo posto finale.
Dal gennaio 2011 il Mainz disputerà i match casalinghi nel nuovo stadio, la Coface Arena. Nella stagione 2010-2011, sotto la guida di Thomas Tuchel, allenatore promosso dalla seconda squadra, il Mainz ha vinto sette partite su sette in Bundesliga eguagliando il record di Bayern Monaco e Kaiserslautern.
